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Café com Física

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13 de março de 2013
16h30
Sala F-210

Rinaldo Wander Montalvão
Instituto de Física de São Carlos - USP


Usando dados esparsos de Ressonância Magnética Nuclear e Modelagem Comparativa para a determinação simultânea de estrutura e dinâmica de proteínas (.zip)

Nesse seminário irei apresentar um sistema híbrido de bioinformática para a determinação simultânea da estrutura terciária e da dinâmica de proteínas. Irei discutir novas metodologias que tratem o problema de solucionar a estrutura de proteínas, onde métodos tradicionais de Cristalografia de Raios-X e Ressonância Magnética Nuclear (RMN) falham.
A nossa idéia básica  é gerar um “ensemble” de estruturas  que reflitam os dados experimentais, através do uso de dois procedimentos distintos:
1 -  Modelagem Comparativa de Proteínas usando "environment-specific substitution tables" desenvolvido no grupo do professor Sir Tom Blundell no Departamento de Bioquímica da Universidade de Cambridge.
2 - Dinâmica Molecular Auxiliada por RMN criado no grupo do professores Michele Venduscolo e Chris Dobson no Departamento de Química da Universidade de Cambridge.



                       
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