Café com Física |
13 de março de 2013
16h30 Sala F-210 Rinaldo Wander Montalvão Instituto de Física de São Carlos - USP Usando dados esparsos de Ressonância Magnética Nuclear e Modelagem Comparativa para a determinação simultânea de estrutura e dinâmica de proteínas (.zip) Nesse seminário irei apresentar um sistema híbrido de bioinformática para a
determinação simultânea da estrutura terciária e da dinâmica de proteínas.
Irei discutir novas metodologias que tratem o problema de solucionar a
estrutura de proteínas, onde métodos tradicionais de Cristalografia de
Raios-X e Ressonância Magnética Nuclear (RMN) falham.
A nossa idéia básica é gerar um “ensemble” de estruturas que reflitam os dados experimentais, através do uso de dois procedimentos distintos: 1 - Modelagem Comparativa de Proteínas usando "environment-specific substitution tables" desenvolvido no grupo do professor Sir Tom Blundell no Departamento de Bioquímica da Universidade de Cambridge. 2 - Dinâmica Molecular Auxiliada por RMN criado no grupo do professores Michele Venduscolo e Chris Dobson no Departamento de Química da Universidade de Cambridge. |